目前在我国的工业企业中，谐波的危害主要表现在以下几个方面：
（1）引起电压畸变
因为电源系统有内阻抗，所以谐波负荷电流将造成电压波形的谐波电压畸变（这是产生“平顶”波的根源）。此阻抗有两个组成部分：电源接口（PCC）以后的电气装置内部电缆线路的阻抗和PCC以前电源系统内的阻抗。由非线性负荷引起的畸变负荷电流在电缆的阻抗上产生一个畸变的电压降。合成的畸变电压波形加到与此同一电路所接的全部其他负荷上，引起谐波电流的流过，即使这些负荷是线性负荷也是如此。
（2）导致电力电缆发热
当高频电流通过导线时，电流具有集肤效应，显然高次谐波电流的存在使线路集肤效应加重，线路外表面电流密度加大，从而导致线路（相线及中性线）发热。
（3）电动机
谐波电压在电动机短路阻抗上产生的谐波电流和电动机负序基波电流一起使设备产生附加热损耗，并且在电动机起动时容易发展成干扰力矩，造成电动机起动困难，运行效率降低。谐波含量过高会导致电动机损坏。
（4）电容器
由于电网中IC的参数配合关系，电容器不可避免的对部分谐波有放大作用。如电容器参数选择不当，投入电容进行无功功率补偿，以及大幅度降低基波无功电流时，就有可能出现供电电流和电容器电流中谐波和分数谐波电流大幅度增加，从而引起电容器超温和过压，进而损坏。近年来，工业企业中无功补偿电容器使用寿命的大大缩短也正是与此有关。
（5）继电保护
谐波会导致继电保护和自动装置的误动作，并会使电气测量仪表计量不准确，是电网稳定运行的一大隐患。
此外，谐波对电子设备的危害以及对通讯的影响也是显而易见的。电力电子装置所产生的谐波污染已成为阻碍电力电子技术自身发展的重大障碍。对电力系统这个环境来说，无谐波是绿色环保的主要标志之一。
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